Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cox8bP48772 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cox8bP48772 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms