Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Tlx1P43345 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tlx1P43345 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms