Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdf5P43027 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms