Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tac1P41539 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tac1P41539 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tac1P41539 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms