Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ThpoP40226 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ThpoP40226 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ThpoP40226 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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