Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Traf2P39429 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms