Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
LoxP28301 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
LoxP28301 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
LoxP28301 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
LoxP28301 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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