Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ms4a1P19437 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms