Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ifrd1P19182 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms