Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp53P15975 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp53P15975 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms