Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
OtcP11725 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
OtcP11725 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
OtcP11725 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
OtcP11725 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
OtcP11725 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms