Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fv4P11370 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms