Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd4P10628 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Hoxd4P10628 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms