Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Becn2P0DM65 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Becn2P0DM65 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms