Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01837 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01837 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01837 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01837 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms