Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccl20O89093 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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