Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Sp100O35892 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Sp100O35892 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sp100O35892 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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