Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cops5O35864 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms