Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm20830J3KML6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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