Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Rnf169E9Q7F2 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf169E9Q7F2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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