Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccdc6D3YZP9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc6D3YZP9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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