Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rrn3B2RS91 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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