Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2012B1B0R1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2012B1B0R1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms