Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cldn6Q9Z262 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cldn6Q9Z262 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn6Q9Z262 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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