Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pacsin2Q9WVE8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin2Q9WVE8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms