Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Fam50bQ9WTJ8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam50bQ9WTJ8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms