Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHF8Q9UPP1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHF8Q9UPP1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms