Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Plod2Q9R0B9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Plod2Q9R0B9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms