Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkp3Q9QY23 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkp3Q9QY23 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms