Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChmQ9QXG2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ChmQ9QXG2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms