Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdcQ9QW08 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms