Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms