Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx5Q9JKQ4 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx5Q9JKQ4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms