Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nova1Q9JKN6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nova1Q9JKN6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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