Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Stx6Q9JKK1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms