Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Cldn19Q9ET38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn19Q9ET38 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms