Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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Pgpep1Q9ESW8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pgpep1Q9ESW8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pgpep1Q9ESW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pgpep1Q9ESW8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms