Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Trim39Q9ESN2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trim39Q9ESN2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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