Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1Q9ESG2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ropn1Q9ESG2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms