Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Slco1c1Q9ERB5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1c1Q9ERB5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms