Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rpgrip1Q9EPQ2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms