Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Xab2Q9DCD2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Xab2Q9DCD2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms