Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpf4Q9DAW6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpf4Q9DAW6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms