Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Subh2bvQ9D9Z7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms