Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Efhd1Q9D4J1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Efhd1Q9D4J1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms