Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx17Q9D0I4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx17Q9D0I4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx17Q9D0I4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Stx17Q9D0I4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Stx17Q9D0I4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms