Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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SdhdQ9CXV1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SdhdQ9CXV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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SdhdQ9CXV1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SdhdQ9CXV1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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