Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RpainQ9CWY9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RpainQ9CWY9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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