Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chmp3Q9CQ10 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chmp3Q9CQ10 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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