Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2a1Q99PM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms